Takedan juuret ulottuvat yli 230 vuoden taakse vuoteen 1781, jolloin Chobei Takeda I perusti lääkkeiden jakelu- ja tukkukauppatoimintaa harjoittavan yrityksen Japanissa. Vuonna 1871 Chobei Takeda IV laajensi yritystoimintaa ja aloitti ”länsimaisten” lääkkeiden maahantuonnin Japaniin mm. malarian ja koleran hoitoon. Tästä yritys on kasvanut nykyiseksi moderniksi yhtiöksi, joka kattaa niin tutkimuksen ja tuotekehityksen, tuotannon kuin markkinoinninkin. Takedan oma tutkimustoiminta käynnistyi 1900-luvun alussa, ja siitä lähtien tutkimus ja tuotekehitys on ollut yksi Takedan liiketoiminnan kulmakivistä.

1960-luvulla Takedan liiketoiminta laajeni Aasiaan, Yhdysvaltoihin ja Eurooppaan. Viimeistään 2000-luvulla Yhdysvalloissa ja Euroopassa tehdyt merkittävät yritysostot ovat muuttaneet Takedan japanilaisesta lääkeyrityksestä globaaliksi lääkeyritykseksi.

Suoraselkäinen ja rehellinen toimintaperiaate on ohjannut Takedan toimintaa heti perustamisesta lähtien, kun Chobei Takeda I päätti olla kastelematta yrttejä sitä varten, että niihin saataisiin lisää painoa, kuten monilla oli tuohon aikaan tapana. Hänen sinetistään tuli laadun tae. Tämän periaatteen avulla Takeda on saavuttanut nykyisen asemansa merkittävänä globaalina lääkealan toimijana ja Japanin suurimpana lääkeyrityksenä.